Cette affection, beaucoup plus rare et de description plus récente, est caractérisée par une anomalie fonctionnelle de l'échange Na+-H+ au niveau de la membrane de la bordure en brosse de l’intestin. L’anomalie est bien mise en évidence par les techniques de perfusion intestinale. 

Il existe en général un hydramnios (diarrhée fœtale), et une diarrhée à début néonatal. La diarrhée abondante et liquide est particulière par sa richesse en Na+ et en bicarbonates. Les formes cliniques de cette anomalie congénitale sont mal connues, elle peut être transitoire mais aussi particulièrement grave.

La prévalence est inférieure à 1/1 000 000 000, avec moins de 15 cas reportés.

Le diagnostic repose sur les caractéristiques de la diarrhée et les signes biologiques (acidose métabolique), les autres mécanismes d'absorption n'étant pas altérés. 

Le traitement repose sur la correction par voie veineuse puis orale des troubles ioniques. Il est nécessaire d’assurer une bonne hydratation et de compenser les pertes de sodium et de chlore. Lorsque l'enfant prend de l'âge, la diarrhée persiste mais les épisodes de déshydratation deviennent moins fréquents et moins sévères, et une vie et une croissance pratiquement normales peuvent être obtenues.

La transmission serait probablement autosomique récessive. Le gène n’est actuellement pas identifié.